Высокое разнообразие кишечной микробиоты новорожденных снижает риск тяжелых вирусных инфекций дыхательных путей
Крупное исследование британских ученых показало, что состав микробиоты кишечника в первую неделю жизни влияет на риск тяжелого течения вирусных инфекций нижних дыхательных путей в первые два года жизни. В том числе авторы продемонстрировали, что вид Bacteroides dorei обладал защитным эффектом, а Rothia mucilaginosa ассоциирован с повышенным риском госпитализации с вирусной инфекцией нижних дыхательных путей.
Исследование, проведенное в рамках Baby Biome Study в Великобритании, включало более тысячи младенцев, у которых в первую неделю жизни отбирали образцы кала и проводили их метагеномное секвенирование. Целью работы было выявить, связаны ли особенности микробиоты кишечника с частотой госпитализаций по поводу вирусных инфекций нижних дыхательных путей в первые два года жизни ребенка. Ученые оценивали разнообразие микробиоты и выделяли типы бактериальных сообществ.
По результатам исследования авторы выделили три кластера микробиоты: смешанный (кластер 1), с преобладанием Bifidobacterium breve (кластер 2) и с преобладанием Bifidobacterium longum (кластер 3). Третий кластер встречался только у детей, рожденных естественным путем, характеризовался более высоким содержанием B. longum, B. bifidum, B. adolescentis и Bacteroides dorei и повышенным альфа-разнообразием. Оказалось, что более высокое альфа-разнообразие микробиоты было ассоциировано со снижением риска госпитализации с вирусной инфекцией нижних дыхательных путей (скорректированное HR по индексу Шеннона 0,57). Дети с микробиотой кластера 3 имели значительно более низкие показатели госпитализации по сравнению с остальными детьми: скорректированное HR для детей с микробиотой кластера 1 и 2 составило 3,05 и 2,80 соответственно при сравнении с кластером 3. Стоит отметить, что присутствие Bacteroides dorei было ассоциировано с защитой, а Rothia mucilaginosa — с повышенным риском госпитализации.
Авторы подчеркивают важную роль раннего формирования микробиоты для иммунитета и перспективы профилактики тяжелых инфекций дыхательных путей через воздействие на микробиоту.