Неинвазивные тест-полоски выявляют маркеры иммунной и эпидермальной гиперплазии при тяжелых орфанных ихтиозах
В работе, опубликованной в Journal of Investigative Dermatology, 9 апреля, методом мини-инвазивного РНК-секвенирования (ленточная ПЦР) исследователи показали, что при всех подтипах орфанных ихтиозов: синдроме Нетертона, врожденной ихтиозиформной эритродермии, пластинчатом и эпидермолитическом ихтиозе, имеет место повышенная экспрессия иммунных маркеров Th17/Th22 и генов комплекса дифференцировки эпидермиса (EDC)
Чтобы охарактеризовать молекулярные профили четырех редких подтипов ихтиоза, исследователи из Маунт-Синай (Нью-Йорк) и Северо-Западного университета (Чикаго) собрали данные РНК-секвенирования 27 пациентов с ихтиозом и 18 здоровых людей. Среди пациентов: 9 с синдромом Нетертона, 6 с врожденной ихтиозиформной эритродермией, 7 с пластинчатым и 5 с эпидермолитическим ихтиозом (средний возраст 17-26 лет; 67-80% женщин). Контроль: средний возраст 24,7 года; 78% женщин.
РНК выделена из 20 последовательных тейп-стрипов, проанализирована с помощью метода РНК-секвенирования с использованием наборов для скрининга экспрессии генов человека Ion AmpliSeq Transcriptome, позволяющих выявить более 20 000 генов.
Дифференциальную экспрессию гена определяли как кратное изменение >2 и частоту ложных обнаружений (False Discovery Rate) <0,05. В корреляционном анализе Спирмена оценивались взаимосвязи между экспрессией генов и показателями индекса площади ихтиоза и степени тяжести (IASI), а также между результатами, полученными с помощью забора материалов тейп-стрипами и ранее опубликованными транскриптомами биопсий.
Было обнаружено, что при всех подтипах повышена экспрессия маркеров Th17 (CCL20, IL36G, IL6) и Th22 (S100A7/8/9, PI3, SERPINB4) - с изменением экспрессии от 11 до 228 раз (P<0,05).
При синдроме Нетертона - уникальная активация IL17A/F, IL23A и IL22, а также выраженная дисрегуляция Th2 (IL13, CCL22/24, CCR4, OX40L).
IL4R и IL10 повышены при пластинчатом и эпидермолитическом ихтиозе (в 9-25 раз).
Тяжесть заболевания, измеренная по шкале IASI, положительно коррелировала с церамидсинтазой 3, несколькими маркерами Th17 и генами поздней стадии формирования рогового слоя, такими как LCE1B/1C/1D/1F/2A/2C/2D (R, 0,49-0,61; P < .05).
Корреляции тейп-стрипов с биопсией по иммунным генам сильнее всего при синдроме Нетертона (R=0,47) и врожденной ихтиозиформной эритродермии (R=0,72), по маркерам EDC - значимы для всех подтипов (R=0,38–0,61).
Это исследование показало, что «с помощью тейп-полосок можно оценить иммунные и барьерные нарушения» при синдроме Нетертона, врожденной ихтиозиформной эритродермии, пластинчатом ихтиозе и эпидермолитическом ихтиозе. «Выявлена значительная дисрегуляция, которая коррелировала с показателями тяжести заболевания и в целом соответствовала изменениям, выявленным при биопсии», - пишут авторы. Учитывая «минимальную инвазивность этого метода взятия образцов», они добавили, что полоски скотча «могут стать ценным инструментом для изучения ихтиоза, учитывая преобладание детей в этих группах, неоднородность реакции на лечение в каждом подтипе и возможность отслеживать изменения в динамике лечения в будущих клинических испытаниях».
Из ограничений данного исследования следует отметить малую выборку, преобладание женщин и белых среди пациентов, что ограничивает обобщаемость.